Laboratorio di Calcolo e Simulazione Atomistici

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Ente di Afferenza
Università degli Studi di Cagliari
Area / Struttura
Dipartimento di Fisica
Sede
Cittadella Universitaria di Monserrato
Responsabile Laboratorio
Luciano Colombo
Descrizione
Il laboratorio sviluppa ed applica metodi di calcolo e simulazione atomistici (ab initio e empirici) di dinamica molecolare, struttura elettronica,simulazioni Monte Carlo e di eventi rari.Si utilizzano infrastrutture di calcolo ad alte prestazioni e numerose tipologie di codici numerici. Attività principali:
-Materiali per energia ed applicazioni avanzate
Modellazione atomistica di materiali convenzionali e nano-sistemi (anche a dimensionalità ridotta)di impiego in produzione di energia e (nano)dispositivi innovativi per l'ingegneria dell'informazione.
-Biofisica molecolare
Modellazione di sistemi e processi d'interesse biologico e farmacologico.Si svolgono ricerche teorico/computazionali riguardanti la comprensione di processi biologici sia fondamentali, sia aventi ricadute in ambito biotecnologico e medico,si mantiene un database di proprietà chimico fisiche di molecole d'interesse farmacologico.
-Fisica delle proprietà emergenti nei solidi
Modellazione di materiali e nanostrutture in cui emergono proprietà elettroniche non
convenzionali.Si svolgono ricerche teoriche su sistemi dotati di diversi stati d'ordine coesistenti e con proprietà topologiche non convenzionali
Attività rivolte alle imprese,
enti pubblici, cittadini
Partecipazione a progetti nazionali di ricerca in partenariato
Partecipazione a progetti internazionali di ricerca in partenariato
Didattica Universitaria
Attività rivolte ai ricercatori
Partecipazione a progetti nazionali di ricerca in partenariato
Partecipazione a progetti internazionali di ricerca in partenariato
Servizi del Laboratorio
Simulazione numerica ed interpretazione chimico-fisica dei risultati
Servizio offerto all'esterno con tariffario: NO
Simulazione numerica ed interpretazione chimico-fisica dei risultati per il "virtual prototyping" di nuovi (nano)materiali e complessi molecolari per applicazioni avanzate nel campo della produzione di energia, della ingegneria dell'informazione, della biologia e della medicina.
Strumenti utilizzati: Strumenti informatici specifici
Strumenti del Laboratorio
Computing software
Elenco codici per tipologia di applicazione: - Dinamica molecolare: codici ACEMD, NAMD, GROMACS, AMBER, PLUMED, LAMPPS. - Chimica quantistica e Fisica computazionale della materia: codici GAUSSIAN, NWCHEM, TURBOMOLE, Quantum ESPRESSO, ABINIT, VASP, SIESTA. - Homology modeling: codice MODELLER - Molecular docking: codici ATTRACT, rDock, codici open-source e plug-ins ad accesso libero per PyMOL, AutoDockTools, AutoDock Vina, AutoDock. - Visualizzazione: VMD, PyMOL, Jmol and JSmol, CHIMERA, AVOGADRO
Server general-purpose multi-core a connessione Infiniband
Sono a disposizione dei ricercatori alcuni server general-purpose multi-core a connessione Infiniband da utilizzare per applicazioni software MPI-optimized. Configurazione disponibile: - 16 multi-CPU, multi-core servers: 2x CPU Intel Xeon CPU E5450 @ 3.00GHz, RAM DDR2-667 16 GB, hard disk SATA2, 500 MB, 7200 RPM, HCA Infiniband 4x DDR.
Server multi-core multi-GPU
Sono a disposizione dei ricercatori alcuni server multi-core multi-GPU da utilizzare per applicazioni software GPU-optimized. Configurazione disponibile: - 9 multi-core, multi-GPU servers: CPU Intel Core i7-3930K @ 3.20GHz, RAM DDR3-1600 16 GB, 4x hard disk SATA3, 3 TB, 7200 RPM (RAID5), 4x GPU NVIDIA GeForce GTX TITAN.
Server multi-core multi-GPU
Sono a disposizione dei ricercatori alcuni server multi-core multi-GPU da utilizzare per applicazioni software GPU-optimized. Configurazioni disponibile: -3 multi-core, multi-GPU servers: CPU Intel Core i7-4960X @ 3.60GHz, RAM DDR3-1600 16 GB, 4x hard disk SATA3, 3 TB, 7200 RPM (RAID5), 4x GPU NVIDIA GeForce GTX TITAN Black.
Server multi-core multi-GPU
Sono a disposizione dei ricercatori alcuni server multi-core multi-GPU da utilizzare per applicazioni software GPU-optimized. Configurazione disponibile: 1 multi-core, multi-GPU servers: CPU Intel Core i7-4960X @ 3.60GHz, RAM DDR3-1600 16 GB, 4x hard disk SATA3, 3 TB, 7200 RPM (RAID5), 4x GPU NVIDIA GeForce GTX 980.
Server multi-core multi-GPU
Sono a disposizione dei ricercatori alcuni server multi-core multi-GPU da utilizzare per applicazioni software GPU-optimized. Configurazione disponibile: -1 multi-core, multi-GPU servers: CPU Intel Core i7-4960X @ 3.60GHz, RAM DDR3-1600 16 GB, 4x hard disk SATA3, 3 TB, 7200 RPM (RAID5), 4x GPU NVIDIA GeForce GTX 980
Server multi-core multi-GPU
Sono a disposizione dei ricercatori alcuni server multi-core multi-GPU da utilizzare per applicazioni software GPU-optimized. Configurazione disponibile: -2 multi-core, multi-GPU servers: CPU Intel Core i7-5960X @ 3.00GHz, RAM DDR4-2133 16 GB, 4x hard disk SATA3, 3 TB, 7200 RPM (RAID5), 4x GPU NVIDIA GeForce GTX 980
Server multi-core multi-GPU
Sono a disposizione dei ricercatori alcuni server multi-core multi-GPU da utilizzare per applicazioni software GPU-optimized. Configurazione disponibile: -1 multi-core, multi-GPU server: CPU Intel Core i7-5960X @ 3.00GHz, RAM DDR4-2133 16 GB, 4x hard disk SATA3, 3 TB, 7200 RPM (RAID5), 4x GPU NVIDIA GeForce TITAN X
Server multi-core multi-GPU
Sono a disposizione dei ricercatori alcuni server multi-core multi-GPU da utilizzare per applicazioni software GPU-optimized. Configurazione disponibile: -2 multi-CPU, multi-core servers: 4x CPU Intel Xeon E5-4620 v2 @ 2.60GHz, RAM DDR3-1600 128 GB, 4x hard disk SATA3, 3TB, 7200 RPM (RAID5)
Server multi-core multi-GPU
Sono a disposizione dei ricercatori alcuni server multi-core multi-GPU da utilizzare per applicazioni software GPU-optimized. Configurazione disponibile: -4 multi-CPU, multi-core servers: 2x CPU Intel Xeon E5-2650 v2 @ 2.60GHz, RAM DDR3-1600 128 GB, 4x hard disk SATA3, 3TB, 7200 RPM (RAID5)
Server multi-core multi-GPU
Sono a disposizione dei ricercatori alcuni server multi-core multi-GPU da utilizzare per applicazioni software GPU-optimized. Configurazione disponibile: -1 multi-CPU, multi-core servers: 2x CPU Intel Xeon E5-2690 @ 2.90GHz, RAM DDR3-1600 128 GB, 6x hard disk SATA3, 4TB, 7200 RPM (RAID5)
Server multi-core multi-GPU
Sono a disposizione dei ricercatori alcuni server multi-core multi-GPU da utilizzare per applicazioni software GPU-optimized. Configurazione disponibile -5 multi-core, multi-GPU servers: CPU Intel Core i7-5960X @ 3.00GHz, RAM DDR4-2133 16 GB, 4x hard disk SATA3, 3 TB, 7200 RPM (RAID5), 4x GPU NVIDIA GeForce GTX 1080.
Modalità di accesso
Il laboratorio è disponibile su prenotazione.
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Dove si trova
Monserrato, Cittadella Universitaria di Monserrato, S.S. 554 bivio per Sestu.