Laboratorio di Patogenomica dei Tumori Solidi
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Ente di Afferenza
Università degli Studi di Cagliari
Area / Struttura
Dipartimento di Scienze Biomediche
Sede
Cittadella Universitaria di Monserrato
Responsabile Laboratorio
Roberta Vanni
Descrizione
Il laboratorio si occupa dello studio dell'instabilità genomica in cellule del cancro al fine di determinarne gli eventi correlati allo sviluppo della proliferazione neoplastica.
Studio di marcatori genetici associati a specifiche tipologie tumorali.
Caratterizzazione citogenetica-molecolare di carcinomi differenziati della tiroide e ruolo dei telomeri nello sviluppo della variante familiare.
Isolamento e caratterizzazione biologico molecolare di cellule staminali tumorali da linee cellulari derivate da tumori differenziati della tiroide ed in tumori primari ex-vivo.
Disegno sperimentale e preparazione di probes multi-fluorescenti per la rilevazione in situ di geni di fusione nei tumori solidi.
Studio di marcatori genetici associati a specifiche tipologie tumorali.
Caratterizzazione citogenetica-molecolare di carcinomi differenziati della tiroide e ruolo dei telomeri nello sviluppo della variante familiare.
Isolamento e caratterizzazione biologico molecolare di cellule staminali tumorali da linee cellulari derivate da tumori differenziati della tiroide ed in tumori primari ex-vivo.
Disegno sperimentale e preparazione di probes multi-fluorescenti per la rilevazione in situ di geni di fusione nei tumori solidi.
Attività rivolte alle imprese,
enti pubblici, cittadini
enti pubblici, cittadini
Partecipazione a progetti nazionali di ricerca in partenariato
Didattica Universitaria
Didattica Universitaria
Attività rivolte ai ricercatori
Partecipazione a progetti nazionali di ricerca in partenariato
Servizi del Laboratorio
Allestimento di Colture Cellulari
Servizio offerto all'esterno con tariffario: NO
Allestimento di colture cellulari a breve termine da tessuti solidi normali/ tumorali e da sangue per lo studio del cariotipo.
Strumenti utilizzati: Incubatore a CO2; cappa a flusso laminare verticale; invertoscopio; centrifuga da banco; termostati; contenitori per stoccaggio cellule; conta cellule elettronico; congelatore a -80°C.
Allestimento di Preparati Citogenetici
Servizio offerto all'esterno con tariffario: NO
Allestimento di preparati per lo studio del cariotipo tramite metodiche di citogenetica convenzionali.
Strumenti utilizzati: Microscopio ottico
DNA Breakage Detection FISH (DBD FISH)
Servizio offerto all'esterno con tariffario: NO
Tecnica che permette il rilevamento dei siti di rottura del DNA, e le caratteristiche strutturali della cromatina.
Strumenti utilizzati: Sistema automatizzato per ibridazione in situ
Estrazione di Nuclei
Servizio offerto all'esterno con tariffario: NO
Estrazione di nuclei da tessuti tumorali non inclusi ed inclusi in paraffina.
Strumenti utilizzati: Bagnetto a temperatura costante; centrifuga da banco
Ibridazione Genomica Comparativa (CGH)
Servizio offerto all'esterno con tariffario: NO
Ibridazione comparativa del genoma per l'identificazione di anomalie del DNA (delezioni, duplicazioni, amplificazioni), non rivelabili con le metodiche citogenetiche convenzionali. Le variazioni del numero di copie del DNA si associano a sindromi malformative e/o patologie tumorali.
Strumenti utilizzati: Sistema automatizzato per ibridazione in situ
Ibridazione in Situ (FISH)
Servizio offerto all'esterno con tariffario: NO
Tecnica FISH applicata su campioni pre/postchirurgici tumorali con sonde di DNA centromeriche, geni singoli, Whole Chromosome Painting (WCP), Partial Chromosome Painting (PCP), sonde telomeriche di Peptide Nucleic Acid (PNA).
Strumenti utilizzati: Sistema automatizzato per ibridazione in situ
Isolamento di Cellule Staminali
Servizio offerto all'esterno con tariffario: NO
Isolamento e propagazione di cellule staminali da linee cellulari umane normali e tumorali e da pezzi chirurgici.
Strumenti utilizzati: Incubatore a CO2; cappa a flusso laminare verticale; invertoscopio; centrifuga da banco; termostati; contenitori per stoccaggio cellule; conta cellule elettronico; congelatore a -80°C.
Marcatura di DNA
Servizio offerto all'esterno con tariffario: NO
Marcatura diretta di DNA con molecole fluorescenti mediante la tecnica di Nick Translation.
Strumenti utilizzati: Termociclatore per PCR; centrifuga refrigerata da banco
Marcatura indiretta di DNA
Servizio offerto all'esterno con tariffario: NO
Marcatura di DNA indiretta con apteni mediante tecnica di Nick Translation.
Strumenti utilizzati: Termociclatore per PCR; centrifuga refrigerata da banco
Vettori di Clonaggio ed Estrazione di DNA da Plasmidi
Servizio offerto all'esterno con tariffario: NO
Espansione di vettori di clonaggio ed estrazione di DNA da plasmidi BAC e PAC e da varie tipologie tissutali (tessuti tumorali inclusi in paraffina, saliva, sangue, urine).
Strumenti utilizzati: Bagnomaria Dubnoff a scuotimento orizzontale; centrifuga refrigerata da banco; spettrofotometro UV-Vis.
Strumenti del Laboratorio
Microscopio a fluorescenza Olympus BX41
Il microscopio a fluorescenza si utilizza con dei campioni trattati con composti fluorescenti in modo da essere in grado di emettere luce di una specifica lunghezza d'onda quando eccitati con luce di lunghezza d'onda inferiore.
Microscopio a fluorescenza Olympus BX41
Il microscopio a fluorescenza si utilizza con dei campioni trattati con composti fluorescenti in modo da essere in grado di emettere luce di una specifica lunghezza d'onda quando eccitati con luce di lunghezza d'onda inferiore.
Microscopio a fluorescenza Olympus BX60
Il microscopio a fluorescenza si utilizza con dei campioni trattati con composti fluorescenti in modo da essere in grado di emettere luce di una specifica lunghezza d'onda quando eccitati con luce di lunghezza d'onda inferiore.
Piastra riscaldante per ibridazione in situ Hybrite Visis
Piastra riscaldante per ibridazione in situ.
Piastra riscaldante per ibridazione in situ Hybrite Visis
Piastra riscaldante per ibridazione in situ.
Sistema di acquisizione di immagini Microdoc System ECX-F20M
Sistema con cono e fotocamera digitale integrata e display a 8 pollici, equipaggiato con un transilluminatore a raggi UV per la fotodocumentazione di gel.
Termociclatore per PCR Eppendorf Mastercycler Personal
Termociclatore per PCR a 24 pozzetti per l'amplificazione di tratti di DNA e reazioni di ibridazione utilizzando cicli di temperatura controllati.
Transilluminatore a raggi UV Eppendorf
Transilluminatore a raggi UV per la visualizzazione di gel di elettroforesi tramite l'utilizzo di agenti intercalanti e fluorescenti (Bromuro di Etidio, SYbrSafe).
Modalità di accesso
Il laboratorio è disponibile su prenotazione.
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Dove si trova
Monserrato, Cittadella Universitaria di Monserrato, S.S. 554 bivio per Sestu